Exacta metoodika

Keemiaravi juhtimine

Kemoterapeutikumide tundlikkuse testimine tsirkuleerivatel kasvajarakkudel

Keemiaravi tundlikkuse testimine (chemosensitivity testing) võimaldab hinnata kasvajarakkude tundlikkust erinevate kemoterapeutikumide suhtes juba enne ravi alustamist. Hoolimata sihtmärkravi ja immunoteraapia kiirest arengust on keemiaravi endiselt üks vähiravi alustalasid ning sageli kasutatakse seda kombineeritud raviskeemide osana.

Kliinilises praktikas hinnatakse keemiaravi efektiivsust enamasti alles pärast mitut ravitsüklit, näiteks kasvaja mahu muutuse alusel kompuuteruuringutel. Ainuüksi geneetiline profiil ei võimalda alati ennustada ravivastust. Ka geneetiliselt sarnased kasvajad võivad reageerida ravimitele väga erinevalt, kuna nende käitumist mõjutavad lisaks geenimuutustele ka RNA aktiivsus, epigeneetilised mehhanismid ja kasvajat ümbritsev mikrokeskkond.

A medical professional studies CT scans on multiple monitors in a dimly lit medical office.

Exacta uuringus kasutatakse funktsionaalset täppisonkoloogia lähenemist, mille käigus hinnatakse laboritingimustes tsirkuleerivate kasvajarakkude tegelikku reaktsiooni erinevatele keemiaravimitele. See võimaldab prognoosida ravimite tõhusust enne nende manustamist patsiendile.

Meetodit toetavad kliinilised uuringud enam kui 5000 patsiendil. Tsirkuleerivate kasvajarakkude ja samalt patsiendilt pärineva kasvajakoe võrdlemisel on funktsionaalse keemiaravitesti kooskõla olnud 93,7%.

Sõltuvalt patsiendi verest eraldatud tsirkuleerivate kasvajarakkude arvust hinnatakse ~30–60 keemiaravimi toimet.

Meetodi eelised

Kliiniliselt tõestatud lähenemine – põhineb ulatuslikel kliinilistel uuringutel.
Tulemused protsentides – näitavad iga ravimi tsütotoksilist mõju kasvajarakkudele.
Ravimite järjestamine efektiivsuse järgi – aruanne toob välja kõige tõenäolisemalt toimivad ravimid.
Ravimite järjestamine efektiivsuse järgi – aruanne toob välja kõige tõenäolisemalt toimivad ravimid.

Immunotsütokeemia (ICC)

Datar Cancer Genetics on välja töötanud uudse meetodi immunotsütokeemia tegemiseks tsirkuleerivatel kasvajarakkudel (CTC). Meetodi käigus iseloomustatakse tsirkuleerivaid kasvajarakke spetsiifiliste antikehade abil, mis võimaldab hinnata kasvaja bioloogilisi omadusi reaalajas. Erinevalt kasvajakoe biopsiast, mis peegeldab kasvaja seisundit proovi võtmise hetkel, annab CTC-de analüüs ülevaate aktiivsest haigusest uuringu tegemise ajal.

Rakkude iseloomustamine võimaldab:

  • jälgida ravisihtmärkide kadumist;
  • tuvastada varajasi raviresistentsuse mehhanisme;
  • kohandada ravi varem kui seda võimaldavad koebiopsia või radioloogilised uuringud.
pharma company template product patient.jpeg

Farmakogeneetika

Farmakogeneetika uurib, kuidas inimese geneetiline taust mõjutab ravimite ainevahetust ning võimaldab prognoosida individuaalseid erinevusi ravimite metabolismis, ravivastuses ja kõrvaltoimete riskis.

Eriti olulised on tsütokroom P450 (CYP450) ensüümid, mis osalevad suure osa kliinilises kasutuses olevate ravimite metabolismis. Need mõjutavad:

  • kui kiiresti ravim organismis aktiveerub;
  • kui kiiresti see lagundatakse;

Kasvajad vabastavad vereringesse tavalisest rohkem eksosoome, mis kannavad endas kasvajale iseloomulikku geneetilist materjali. Meetod on kliiniliselt valideeritud ning eriti väärtuslik olukordades, kus ravi ei ole olnud edukas ja kasvaja käitumist tuleb ravi kohandamiseks uuesti hinnata.

pharma company template product patient.jpeg

Exacta aruanne koondab, millised ravimid sobivad patsiendi geneetilise profiiliga kõige paremini ning milliste ravimite puhul võib olla suurenenud toksilisuse või tõsiste kõrvaltoimete risk. See aitab raviarstil valida patsiendile sobivama raviskeemi juba enne ravi alustamist.

Exacta sisaldab

  • CYP450 geenide genotüpiseerimist
  • ravimite efektiivsuse ja toksilisuse
  • ravimite efektiivsuse ja toksilisuse geneetilist hindamist

Kogu transkriptoomi RNA sekveneerimine

Inimese genoom sisaldab ligikaudu 20 000 valku kodeerivat geeni. RNA sekveneerimine võimaldab määrata, millised neist geenidest on konkreetses rakus või koes antud ajahetkel aktiivsed ning millisel määral need avalduvad.

See on üks Exacta uuringu olulisemaid osi, kuna aitab mõista kasvaja bioloogiat terviklikult, mitte ainult geneetiliste mutatsioonide tasandil.

Aruanne sisaldab patsiendipõhist signaalradade aktiivsuse profiili, mis põhineb KEGG signaalradade analüüsil. Selle abil tuvastatakse:

  • häirunud rakusisesed signaalirajad;
  • kasvaja võimalikud bioloogilised sõltuvused;
  • ravimresistentsuse mehhanismid.

Need teadmised aitavad leida kasvaja nõrkusi, sidudes aktiivsed signaalirajad ravimitega, mis võivad nende aktiivsust pärssida. See toetab teadlikumaid raviotsuseid ning võib sealjuures parandada ravitulemusi.

pharma company template product patient.jpeg

Exacta sisaldab

  • kogu inimese transkriptoomi ehk ligikaudu 20 000 geeni RNA ekspressiooni analüüsi. RNA-d saab eraldada nii parafiinplokki säilitatud kasvajakoest kui ka patsiendi veres leiduvatest eksosoomidest.
  • Ravimite järjestamine efektiivsuse järgi – aruanne toob välja kõige tõenäolisemalt toimivad ravimid.
  • Lai ravimivalik – analüüs hõlmab standardset ravimipaneeli ning vajadusel ka täiendavaid ravimeid.

DNA sekveneerimine

DNA sekveneerimise eesmärk on tuvastada ravitavaid geneetilisi muutusi, et leida sihtmärkravi võimalusi. Sihtmärkravimid blokeerivad vähirakkude ebanormaalseid molekulaarseid sihtmärke, kahjustades võimalikult vähe terveid kudesid. Näiteid: Kopsuvähk – EGFR mutatsioonid, ALK ümberkorraldused, ROS1 fusioonid. Rinnavähk – BRCA mutatsioonid. Melanoom –.Jämesoolevähk . Munasarjavähk – BRCA mutatsioonidega seotud PARP inhibiitorid. Sihtmärkravi kasutatakse ka kilpnäärme-, eesnäärme-, mao- ning mõnede ajukasvajate korral.

DNA sekveneerimine võimaldab lisaks määrata olulisi biomarkereid mis aitavad hinnata immunoteraapia võimalikku efektiivsust.

  • TMB (Tumor Mutational Burden);
  • MSI (Microsatellite Instability);
  • HRD/HR biomarkerid,
pharma company template product nurse.jpg

TMB

TMB näitab kasvaja DNA-s leiduvate mutatsioonide koguarvu ning väljendatakse tavaliselt mutatsioonidena megabaasi kohta (mut/Mb).

Kõrge TMB tähendab, et kasvajas on palju mutatsioone, mille tulemusena tekib rohkem ebanormaalseid valke. Need muudavad kasvaja immuunsüsteemile paremini äratuntavaks ning võivad suurendada ravivastust immuunkontrollpunkti inhibiitoritele.

MSI

Kõrge mikrosatelliitide ebastabiilsusega (MSI-H) kasvajad reageerivad sageli hästi immunoteraapiale, sest DNA parandussüsteem on häiritud, mis põhjustab mutatsioonide kuhjumist ja sageli ka TMB suurenemist.

MSI-H või dMMR kasvajad võivad hästi reageerida immuunkontrollpunkti inhibiitoritele sõltumata sellest, millisest koest vähk alguse sai. Tegemist oli ühe esimese biomarkeripõhise, kasvajatüübist sõltumatu immunoteraapia näidustusega.

Kuigi DNA sekveneerimine on paljudel juhtudel kättesaadav ka avalikus tervishoius, ühendab Exacta kasvajakoe DNA analüüsi ja verest määratava ctDNA uuringu. Uuringud on näidanud, et osa olulisi biomarkereid võib olla tuvastatav ainult veres või ainult kasvajakoes. Seetõttu annab mõlema allika samaaegne analüüs kõige täielikuma ülevaate kasvaja molekulaarsest profiilist.

Exacta sisaldab

  • kasvajakoe DNA paneeli analüüsi
  • tsirkuleeriva kasvajast pärineva DNA (ctDNA) analüüsi.

Tulemuste valmimine

Exacta patsiendiaruanne valmib ~14 päeva jooksul.

Scroll to Top